<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:游ゴシック;
        panose-1:2 11 4 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:"MS Pゴシック";
        panose-1:2 11 6 0 7 2 5 8 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@游ゴシック";
        panose-1:2 11 4 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:"\@MS Pゴシック";
        panose-1:2 11 6 0 7 2 5 8 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0mm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"MS Pゴシック";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
p.msonormal0, li.msonormal0, div.msonormal0
        {mso-style-name:msonormal;
        mso-margin-top-alt:auto;
        margin-right:0mm;
        mso-margin-bottom-alt:auto;
        margin-left:0mm;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"MS Pゴシック";}
span.18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:游ゴシック;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;
        font-family:游ゴシック;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:99.25pt 30.0mm 30.0mm 30.0mm;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026">
<v:textbox inset="5.85pt,.7pt,5.85pt,.7pt" />
</o:shapedefaults></xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=JA link="#0563C1" vlink="#954F72"><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>Dear Matt<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>Thank you for your reply.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>I confirmed that chi (k) becomes smooth by the Savitzky-Goley method by doing the attached lar file.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>I will try on various conditions from now.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>I may also ask if there is something I do not understand.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>Thank you for your help again!<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>Bests, <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'>Yuji Mahara<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:游ゴシック'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><b><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif'>From:</span></b><span lang=EN-US style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif'> Ifeffit [mailto:ifeffit-bounces@millenia.cars.aps.anl.gov] <b>On Behalf Of </b>Matt Newville<br><b>Sent:</b> Thursday, April 20, 2017 5:26 AM<br><b>To:</b> XAFS Analysis using Ifeffit <ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov><br><b>Subject:</b> Re: [Ifeffit] The difference of EXAFS oscillation when using Athena and when using Larch<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p><div><div><div><div><p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'><span lang=EN-US>Hi Yuji, <o:p></o:p></span></p></div><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>The attached larch script (a modification of your script but note: not python, so you may have to add a bunch of '_larch=mylarch' arguments) to show the effects of smoothing with Savitzky-Golay and of interpolating onto a "classic XAFS energy grid".   You might want to play around with this different options.  It definitely seems that none of these methods are systematically over-smoothing the data and reducing the amplitudes of the oscillations -- one more reason to use Larch instead of Ifeffit.  But it also seems like smoothing this data with a Savitzky-Golay fitler is helpful.<br><br>Also attached are plots showing k- and R-space generated from the attached script.<o:p></o:p></span></p></div><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p></div><div><div><div><div><p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'><span lang=EN-US>--Matt<o:p></o:p></span></p></div></div></div></div></div></div></body></html>