<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=utf-8" http-equiv=Content-Type></HEAD>
<BODY 
style="WORD-WRAP: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space" 
dir=ltr>
<DIV dir=ltr>
<DIV style="FONT-FAMILY: 'Century'; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV><FONT size=4>Dear Scott,</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
<DIV><FONT size=4>Thanks for your explaination. All the samples were measured at 
77K using a homemade <FONT face=宋体><FONT style="FONT-SIZE: 12pt">cryogenic box. 
I will try to do the Hamilton test according to your 
book.</FONT></FONT></FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3 face=宋体></FONT> </DIV>
<DIV><FONT size=3 face=宋体></FONT> </DIV>
<DIV><FONT size=3 face=宋体>Best,</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3 face=宋体></FONT> </DIV>
<DIV><FONT size=3 face=宋体>Shaofeng</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3 face=宋体></FONT> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV 
style="FONT-FAMILY: 'Century'; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 14pt">--------------------------------------<BR>Shaofeng 
Wang, Ph.D of Geochemistry<BR>Environmental Molecular Science Group<BR>Institute 
of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences<BR>Shenyang, 110016, 
China<BR>wangshaofeng@iae.ac.cn<BR>www.iae.cas.cn<BR><BR></DIV>
<DIV 
style="FONT-STYLE: normal; DISPLAY: inline; FONT-FAMILY: 'Calibri'; COLOR: #000000; FONT-SIZE: small; FONT-WEIGHT: normal; TEXT-DECORATION: none">
<DIV style="FONT: 10pt tahoma">
<DIV> </DIV>
<DIV style="BACKGROUND: #f5f5f5">
<DIV style="font-color: black"><B>From:</B> <A title=scalvin@sarahlawrence.edu 
href="mailto:scalvin@sarahlawrence.edu">Scott Calvin</A> </DIV>
<DIV><B>Sent:</B> Thursday, January 05, 2017 11:50 AM</DIV>
<DIV><B>To:</B> <A title=ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov 
href="mailto:ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov">XAFS Analysis using Ifeffit</A> 
</DIV>
<DIV><B>Cc:</B> <A title=wangshaofeng@iae.ac.cn 
href="mailto:wangshaofeng@iae.ac.cn">Shaofeng Wang</A> </DIV>
<DIV><B>Subject:</B> Fwd: about sigma2 for exafs fitting</DIV></DIV></DIV>
<DIV> </DIV></DIV>
<DIV 
style="FONT-STYLE: normal; DISPLAY: inline; FONT-FAMILY: 'Calibri'; COLOR: #000000; FONT-SIZE: small; FONT-WEIGHT: normal; TEXT-DECORATION: none">Shaofeng 
has given me permission to repost her question here on the ifeffit mailing list. 
It is quoted below my response. 
<DIV> </DIV>
<DIV>Dear Shaofeng,</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>As Bruce and I said before, a sigma2 of 0.0007 A^2 is not impossible, 
although it indicates less disorder than is <I>typically</I> present. Your 
attached table does seem to show some improvement by using the model from the 
hydrogen-containing structure as compared to the arsenate. A more rigorous test 
for statistical improvement can be conducted using the Hamilton test (you 
mentioned you’ve consulted <I>XAFS for Everyone</I>; full details of the 
Hamilton test are given there). </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>It’s also encouraging that the uncertainties on your sigma2 determinations 
using the hydrogen-containing model are quite small; it appears that the fit is 
not getting confused by correlations even though it’s fitting both coordination 
number and sigma2, as that would generally also cause high uncertainties in the 
correlated parameters.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Is such a stiff sigma2 reasonable <I>in this case</I>? I have no idea. I 
just don’t know enough about this particular system; perhaps someone else on the 
list does. Oh, and one other question—was the data collected at room 
temperature? If it were collected at cryogenic temperatures, that would tend to 
reduce thermal disorder and thus lower sigma2’s.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Even if no one on the list has insight in to this particular system, anyone 
have good published examples of room-temperature systems with sigma2’s < 
0.001? It might help Shaofeng with her referee…</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Best,</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Scott Calvin</DIV>
<DIV>Lehman College of the City University of New York</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>P. S. I certainly hope no reviewer is using the “typical values” I provide 
for parameters in <I>XAFS for Everyone</I> as rigid criteria for rejecting 
results! It is most certainly not the way I use them in the book. Some systems 
actually <I>are</I> atypical!<BR>
<DIV><BR>
<BLOCKQUOTE type="cite">
  <DIV>Begin forwarded message:</DIV>
  <DIV> </DIV>
  <DIV style="MARGIN: 0px"><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif; COLOR: "><B>From: 
  </B></SPAN><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif">Shaofeng 
  Wang <<A 
  href="mailto:wangshaofeng@iae.ac.cn">wangshaofeng@iae.ac.cn</A>><BR></SPAN></DIV>
  <DIV style="MARGIN: 0px"><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif; COLOR: "><B>Subject: 
  </B></SPAN><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif"><B>about 
  sigma2 for exafs fitting</B><BR></SPAN></DIV>
  <DIV style="MARGIN: 0px"><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif; COLOR: "><B>Date: 
  </B></SPAN><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif">January 
  4, 2017 at 8:31:33 PM CST<BR></SPAN></DIV>
  <DIV style="MARGIN: 0px"><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif; COLOR: "><B>To: 
  </B></SPAN><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif"><<A 
  href="mailto:scalvin@sarahlawrence.edu">scalvin@sarahlawrence.edu</A>><BR></SPAN></DIV>
  <DIV style="MARGIN: 0px"><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif; COLOR: "><B>Reply-To: 
  </B></SPAN><SPAN 
  style="FONT-FAMILY: -webkit-system-font, helvetica neue, helvetica, sans-serif">Shaofeng 
  Wang <<A 
  href="mailto:wangshaofeng@iae.ac.cn">wangshaofeng@iae.ac.cn</A>><BR></SPAN></DIV>
  <DIV> </DIV>
  <DIV>
  <DIV 
  style="TEXT-TRANSFORM: none; FONT-STYLE: normal; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; FONT-FAMILY: helvetica; WHITE-SPACE: normal; FONT-SIZE: 12px; FONT-WEIGHT: normal; WORD-SPACING: 0px; font-variant-caps: normal; -webkit-text-stroke-width: 0px" 
  dir=ltr>
  <DIV style="FONT-FAMILY: century; FONT-SIZE: 14pt">
  <DIV><FONT size=4>Dear Dr. Calvin,</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4>I am a research from China. I know you are an expert on XAFS 
  analysis. So I write this letter to you for some xafs analysisi problem.<SPAN 
  class=Apple-converted-space> </SPAN></FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4>Recently, I am attempting to study the incorporation of 
  arsenate into the barite structure. To investigate the species of arsenate in 
  barite, I fitted the exafs data using Ba3(AsO4)2 and a dft optimized structure 
  with HAsO<SUB>4<SPAN 
  class=Apple-converted-space> </SPAN></SUB>incorporated in barite 
  supercell (configuration C2), respectively and got some results. Please see 
  the attached table. Smaller reduced chi2 and R-factor were obtained by using 
  configuration C2 as the initial model. Does this mean the species of arsenate 
  in barite is more likely to be HAsO<SUB>4</SUB><SUB></SUB><SUP>2-</SUP><SPAN 
  class=Apple-converted-space> </SPAN>instead of 
  AsO<SUB>4</SUB><SUP>3-<SPAN class=Apple-converted-space> </SPAN></SUP>? 
  We also have other evidences including XANES and vibrational spectroscopy to 
  support this conclusion. However, using C2 as the initial model we obtained 
  samll sigma2 (~0.0007). This seems too small and out of the normal range 
  (0.002 每 0.03) as you mentioned in your publications (XAFS for everyone). So, 
  my question is if our data are reasonable. If yes, could you provid some 
  references to support?</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4>By the way, I asked simialr question on the ifeffit forum 
  and you gave me some answer. However, the reviewer was not convinced and he 
  insited on that sigma2 must be in the range of 0.002-0.03. How can I response 
  this question?</FONT></DIV>
  <DIV> </DIV>
  <DIV><FONT size=4>Any help is very appreciated.</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4>Best regards,</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4>Shaofeng</FONT></DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV><FONT size=4></FONT> </DIV>
  <DIV 
  style="FONT-FAMILY: century; FONT-SIZE: 14pt">--------------------------------------<BR>Shaofeng 
  Wang, Ph.D of Geochemistry<BR>Environmental Molecular Science 
  Group<BR>Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of 
  Sciences<BR>Shenyang, 110016, China<BR><A 
  href="mailto:wangshaofeng@iae.ac.cn">wangshaofeng@iae.ac.cn</A><BR><A 
  href="http://www.iae.cas.cn/">www.iae.cas.cn</A><BR><BR></DIV></DIV></DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV></DIV></DIV></DIV></DIV></BODY></HTML>