<div dir="ltr"><div><div><div>Hi Bruce,<br></div>Thanks for your reply. I am familiar with outer-sphere complexation and how it works but I am much less familiar with Artemis and how such question can be approached. In the past we used Excurve and DL-Excurve where you can simply name the backscatter with initial estimates of N and R but without any need for STRUCTURE. Now, having moved away from these tools into Demeter and Artemis I am trying to learn rather than asking people to do work for me! <br><br></div>So, what I have done so far was to replace Ti in the Atoms file by Ni but it is not clear to me what I need to change in order to test outer-sphere vs inner-sphere complexes of Ni. <br><br></div><div><br>space = P b c n<br>a     =   8.71280    b    =   5.23270    c     =  14.48700<br>alpha =  90.00000    beta =  90.00000    gamma =  90.00000<br>rmax  =   7.84905    core  = Ti<br># polarization = 0.0  0.0  0.0<br>shift =     0.00000    0.00000    0.00000<br>atoms<br># el.     x           y           z        tag<br>  Na     0.06430     0.64500     0.15370   Na        <br>  Ti     0.15130     0.13220     0.33090   Ti        <br>  Si     0.34210     0.29610     0.52670   Si        <br>  O      0.00000     0.00600     0.25000   O1        <br>  O      0.18170     0.44070     0.27580   O2        <br>  O      0.33360     0.29670     0.41520   O3        <br>  O      0.00890     0.24280     0.42800   O4        <br>  O      0.23570     0.05980     0.56700   O5<br><br><br></div><div>Thanks,<br></div><div> G<br></div><div><div><br><br><br><br><br><br><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jun 9, 2016 at 3:58 PM, Bruce Ravel <span dir="ltr"><<a href="mailto:bravel@bnl.gov" target="_blank">bravel@bnl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
This is an very vague and open-ended question.<br>
<br>
Have you read any of the very extensive literature applying EXAFS to outer-sphere complexation?  Have you tried anything ... anything at all ... to solve your problem?<br>
<br>
If you ask specific questions, you will get good answers.  If you ask folks on the list to do your work for you, that won't go so well.<br>
<br>
B<div><div class="h5"><br>
<br>
<br>
On 06/09/2016 10:25 AM, Gnu script wrote:<br>
</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5">
Dear All,<br>
<br>
I am relatively new to Ifeffit and Artemis. I am trying to find a way to<br>
create four-shell model of an outer-sphere complex in Atoms or some<br>
other way readable by Atoms. I have no idea about the geometry, space<br>
group but some rough guess of bond-distances. The model to test against<br>
the EXAFS data is:<br>
Ni is the central atom<br>
Ni-O first shell<br>
Ni-Ni second shell<br>
Ni-Ti third shell<br>
Ni-Si fourth shell<br>
<br>
The model aims to test the adsorption of Ni on the surface of<br>
Ti-containing silicate mineral.<br>
<br>
Could you please help.<br>
<br>
Thanks.<br>
<br>
<br>
<br></div></div>
_______________________________________________<br>
Ifeffit mailing list<br>
<a href="mailto:Ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov" target="_blank">Ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov</a><br>
<a href="http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/listinfo/ifeffit" rel="noreferrer" target="_blank">http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/listinfo/ifeffit</a><br>
Unsubscribe: <a href="http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/options/ifeffit" rel="noreferrer" target="_blank">http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/options/ifeffit</a><br>
<br>
</blockquote>
<br>
<br>
-- <br>
 Bruce Ravel  ------------------------------------ <a href="mailto:bravel@bnl.gov" target="_blank">bravel@bnl.gov</a><br>
<br>
 National Institute of Standards and Technology<br>
 Synchrotron Science Group at NSLS-II<br>
 Building 535A<br>
 Upton NY, 11973<br>
<br>
 Homepage:    <a href="http://bruceravel.github.io/home/" rel="noreferrer" target="_blank">http://bruceravel.github.io/home/</a><br>
 Software:    <a href="https://github.com/bruceravel" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/bruceravel</a><br>
 Demeter:     <a href="http://bruceravel.github.io/demeter/" rel="noreferrer" target="_blank">http://bruceravel.github.io/demeter/</a><br>
_______________________________________________<br>
Ifeffit mailing list<br>
<a href="mailto:Ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov" target="_blank">Ifeffit@millenia.cars.aps.anl.gov</a><br>
<a href="http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/listinfo/ifeffit" rel="noreferrer" target="_blank">http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/listinfo/ifeffit</a><br>
Unsubscribe: <a href="http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/options/ifeffit" rel="noreferrer" target="_blank">http://millenia.cars.aps.anl.gov/mailman/options/ifeffit</a><br>
</blockquote></div><br></div>